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如何正確使用微生物鑒定質(zhì)譜儀進(jìn)行細菌分類(lèi)

更新時(shí)間:2024-06-14      點(diǎn)擊次數:18
   微生物鑒定質(zhì)譜儀通過(guò)測量帶電粒子在電場(chǎng)或磁場(chǎng)中的運動(dòng)來(lái)確定其質(zhì)量與電荷比(m/z)。具體到MALDI-TOFMS,它通過(guò)激光使樣品中的分子解吸和電離,然后測量這些離子飛行時(shí)間(TOF)以確定其m/z。由于不同微生物的蛋白質(zhì)圖譜,因此可以利用這些圖譜進(jìn)行微生物的鑒定和分類(lèi)。
 

 

  樣品制備
 
  1.純培養物的獲?。簽榱双@得準確的結果,首先需要從臨床樣本中分離出純培養物。這通常通過(guò)在選擇性培養基上單菌落分離來(lái)實(shí)現。
 
  2.樣品處理:取少量純培養物,用于質(zhì)譜分析。具體步驟包括:
 
  -直接轉移法:將菌落直接轉移到質(zhì)譜靶板上。
 
  -提取法:對于一些難以直接分析的菌種,可以先進(jìn)行蛋白質(zhì)提取。例如,革蘭氏陰性菌可以用乙醇-甲酸進(jìn)行簡(jiǎn)單提取。
 
  3.基質(zhì)添加:在樣品上加入基質(zhì)(如α-氰基-4-羥基肉桂酸),基質(zhì)在激光照射下幫助樣品分子解吸和電離。
 
  質(zhì)譜分析
 
  1.儀器校準:使用已知標準品對微生物鑒定質(zhì)譜儀進(jìn)行校準,以確保測量的準確性。
 
  2.數據采集:將準備好的樣品靶板放入質(zhì)譜儀,設定適當的激光強度和其他參數,進(jìn)行數據采集。
 
  3.數據處理:生成的原始數據通常是一個(gè)復雜的譜圖。通過(guò)專(zhuān)門(mén)的軟件將這些譜圖轉換為可識別的蛋白質(zhì)圖譜。
 
  數據分析與解釋
 
  1.數據庫匹配:利用數據庫中的參考譜圖對樣品的質(zhì)譜圖進(jìn)行匹配。當前市面上有許多商業(yè)化的微生物質(zhì)譜數據庫,如MALDIBiotyper和VITEKMS。
 
  2.判定標準:匹配結果根據相似度得分進(jìn)行判斷。通常,得分越高,匹配越準確。各公司提供的質(zhì)譜數據庫都有自己的得分閾值,超過(guò)該閾值即可認為鑒定結果可靠。
 
  3.結果驗證:對于罕見(jiàn)或鑒定結果不明確的菌種,可以通過(guò)16SrRNA基因測序等方法進(jìn)一步驗證。
 
  注意事項與常見(jiàn)問(wèn)題
 
  1.樣品純度:混合菌樣品可能導致質(zhì)譜圖復雜化,影響鑒定準確性。因此,確保樣品純度至關(guān)重要。
 
  2.儀器維護:定期校準和維護儀器,以保證其穩定性和準確性。
 
  3.數據庫更新:持續更新質(zhì)譜數據庫,以包含新的微生物譜圖,提高鑒定的覆蓋廣度和準確度。
 
  
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